破解密码

尼奥选择让史密斯感染自己，在复制过程中矩阵掌握了史密斯的代码，最后才得以将他们两个同时删除，使矩阵回到了平衡 关于Matrix Matrix是一个建立在数学基础上的严整系统，一切都是有规律的，包括特工们和尼奥的超能力在内。

结尾的“飞升”象征着人类超级英雄的诞生尼奥将带领锡安基地的人民，打响对机器世界的反击战，并将以胜利者的姿态结束这场战斗，还人类以自由之身实际上，整个黑客帝国2重装上阵是尼奥探寻自己使命背后真相的过程。