尼奥为了人类和母体的和平 单挑史密斯 故意让史密斯吸收，被电脑重新洗牌删除史密斯，重做世界人类和机器和平共处。
黑客帝国4结局是neo潜意识以墨菲斯为蓝本创造了一个虚拟人物墨菲斯，把他的使命设定为引导neo反抗墨菲斯和新人类的一只小队从矩阵中救出了neo他们一起引导Trinity逃脱俩人利用自己的权限大杀四方，最后羞辱了一波。
尼欧突然就打赢了史密斯，和他的身份有关史密斯的“生”第一部最后尼奥觉醒，变成the One ，最后关头通过进入史密斯的身体，篡改了史密斯的程序，认为消灭了史密斯然而在第二部，当尼奥惊讶地发现史密斯并没有死，反而更。